從2016年開始，福建省教育考試院網將開通“自學考試課程免考預申請系統”，系統開通時間：上半年1月15日至2月15日，下半年7月15日至8月15日。系統登錄：登錄福建省教育考試院網（www.eeafj.cn）點擊“自學考試”專欄圖標，選擇“自學考試網上報名”圖標，進入“福建省高等教育自學考試考務考籍管理信息系統”（具體操作可詳見系統幫助）。
系統開通期間，考生根據《福建省高等教育自學考試課程免考實施細則》（http://www.eeafj.cn/zkzkzc/）有關規定：凡用學歷證書申請免考自考課程的以及無法通過網上免考的非學歷證書申請免考自考課程的，均要登錄系統進行課程免考預申請。并在課程免考現場確認期間（上半年2月15日——3月1日，下半年8月15日——9月1日（不含法定節假日、雙休日）），到市、縣（區）教育招生考試機構（試點專業到各主考學校自考辦）提交免考材料，規定時間內未到現場確認的考生，課程免考預申請無效。
考生可登入系統實時查看審核進度及情況。終審結束（上半年5月1日、下半年11月1日）后，系統將開通打印“福建省自學考試課程免考審核情況表”，考生打印后，請妥善保管。
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