根據教育部印發的《普通高等學校高等職業教育（專科）專業設置管理辦法》的有關要求，學院按照教育部《普通高等學校高等職業教育（專科）專業目錄（2015年）》對部分專業進行了調整，從2016年起，學院招生按新《目錄》執行，現在校生仍按原專業培養至畢業。具體專業調整情況如下：
原港口機械應用技術、港口物流設備與自動控制兩個專業合并為港口機械與自動控制專業，該專業分為港口機械、自動控制兩大方向；原港口工程技術專業變更為港口與航道工程技術專業；原港口業務管理、國際航運業務管理兩個專業合并為港口與航運管理專業，該專業分為港口管理、航運管理兩大方向；原汽車技術服務與營銷專業變更為汽車營銷與服務專業；原房地產經營與估價專業變更為房地產經營與管理專業；另外我院新增水路運輸與海事管理專業，該專業自2016年起開始招生。
專業調整后，學院共有30個專業，專業結構更加合理，主要以涉港涉海專業為支撐，重點面向國內外港航及關聯產業培養高素質技術技能型人才。
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