作物科學學院：農學、種子科學與工程
植物保護學院：制藥工程、植物保護（檢驗檢疫方向）、植物保護（有害生物控制方向）
林學院：林學、水土保持與荒漠化防治、生態學、自然地理與資源環境、森林保護
資源與環境學院：農業資源與環境、環境工程、土地資源管理、空間信息與數字技術
園藝學院：園藝、茶學、設施農業科學與工程（都市農業方向）
動物科學學院：動物醫學、動物科學、水產養殖學
蜂學學院：蜂學、中藥資源與開發
經濟學院、農村發展學院（合署）：農村區域發展、農林經濟管理、金融學、國際經濟與貿易
管理學院、旅游學院（合署）：工商管理、會計學、文化產業管理、人力資源管理、旅游管理
機電工程學院：機械設計制造及其自動化（機械電子工程方向）、機械設計制造及其自動化（現代設計制造工程方向）、農業機械化及其自動化、車輛工程、電氣工程及其自動化、電子科學與技術、工業工程
食品科學學院：食品科學與工程、食品質量與安全、食品衛生與營養學
生命科學學院：生物科學（生物學基地班）、生物科學（生態監測與評價方向）、生物科學（藥用植物資源與利用方向）、生物技術、生物信息學、應用化學、生物工程
交通與土木工程學院：土木工程、工程管理、交通運輸、物流管理、交通工程、森林工程（路橋方向）
材料工程學院：木材科學與工程（生物質材料方向）、木材科學與工程（家具工程方向）、輕化工程、化學工程與工藝、材料科學與工程、新能源科學與工程
計算機與信息學院：計算機科學與技術、軟件工程、電子信息工程、網絡工程、信息與計算科學、數學與應用數學、統計學
公共管理學院：行政管理、勞動與社會保障、公共事業管理、公共事業管理（民族班）
文法學院：法學、英語、廣告學
藝術學院、園林學院（合署）：風景園林、園林、環境設計、視覺傳達設計、產品設計、動畫、城鄉規劃
海外學院：園藝（中加合作班）、農業資源與環境（中加合作班）、生態學（中加合作班）
安溪茶學院：茶學、旅游管理、工商管理（企業管理方向）、工商管理（市場營銷方向）、會計學、茶葉生產加工技術、工商企業管理、市場開發與營銷
軟件工程學院：軟件技術、計算機網絡技術、圖形圖像制作（數字媒體制作）
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