計算機科學與技術系創建于1993年，是我校最早利用世界銀行貸款建設起來的系之一。現有軟件工程專業（本科，入選教育部第一批“卓越工程師教育培養計劃”）、計算機科學與技術專業（本科，本專業為國家級服務外包特色專業，與德國合作共建）、計算機科學與技術專業(本科，與德國合作培養2+3)、網絡工程專業(本科)、網絡系統管理專業（專科，與韓國合作培養1.5+1.5）。現在校學生1300余人；專職教師36名，其中教授、副教授12人，博士和在讀博士8人、碩士30人；客座教授２人；兼職教授３人，其中外籍教授２人。他們教學嚴謹、工作敬業、科研能力強、學術造詣深，團隊合作精神強，在人才培養、科研活動中不斷探索和創新，承擔“十一五”國家(重點)課題“我國高校應用型人才培養模式研究”子課題“高等學校計算機專業應用型人才培養模式研究———借鑒德國應用型大學人才培養模式”研究，曾經獲得多項國家自然科學基金和省級科研基金項目，在語音識別、多媒體技術和網絡技術等方面取得了較好的研究成果，建有合肥學院物聯網技術與智能計算研究所。擁有“計算機應用”、“微機原理與接口技術”、“計算機組成原理”、“網絡協議仿真”、“網絡工程”、“計算機軟件”等六個實驗室，實驗室總面積774平方米，各類實驗設備660臺（套），價值900多萬元；建成院重點實驗室“網絡與智能信息處理實驗室”。
根據學校“地方性、應用型、國際化”辦學定位，我系在多年辦學過程中形成了融專業知識、能力素質一體的人才培養方案，多年來為安徽省和合肥市乃至全國的經濟建設輸送了一批又一批的生力軍。國際合作與交流活躍，2006年我系率先與德國威廉哈芬應用科學大學(現改名為雅德大學)合作共建計算機科學與技術專業，實施“2+3”人才培養模式；與韓國濟州漢拿大學合作共建網絡系統管理專業，實施“1.5+1.5”人才培養模式，選拔本、專科優秀學生赴德國、韓國攻讀學位。2008年春季，韓國濟州漢拿大學學生來我系完成計算機科學與技術（本科）專業、網絡工程（本科）專業后兩年的本科學歷學位學業。德國、韓國、日本等高校專家、學者多次來該系訪問、講學，先后選送了12名教師赴美國、德國、英國高校或科研單位學習深造。
以科技活動為主要內容的第二課堂活動豐富多彩，學生參與面廣、創新能力不斷增強。獲第十一屆“挑戰杯”全國大學生課外學術作品競賽世博會專項競賽作品全國決賽一等獎、全國計算機仿真大賽一等獎、二等獎、三等獎，“挑戰杯”大學生創業計劃競賽全國銅獎、安徽省金獎，第十二屆“挑戰杯”課外學術科技作品全國三等獎，第五屆中國成都國際軟件設計與應用大賽個人競賽第三名和第五名，第六屆全國大學生信息技術應用水平大賽三等獎兩項，第二屆中國大學生服務外包創新應用大賽團體優勝獎，安徽省大學生職業生涯規劃大賽銀獎，全國大學生優秀創業團隊大賽安徽省二等獎，全省大學生“弘揚八榮、反對八恥”FLASH設計比賽中獲一等獎、三等獎等多個獎項，“ACM程序設計大賽”獲優勝杯；“三下鄉”暑期社會實踐活動多次受到團省委表彰。中國青年報、安徽衛視、合肥晚報等媒體都曾報道過組織的活動。畢業生受到社會普遍歡迎，就業率連續多年達95%以上，為地方經濟建設與社會和諧發展做出了積極的貢獻。
計算機科學與技術專業（本科）本專業與中德合作共建專業國家級特色專業建設點
學制：四年授予學位：工學學士
培養目標：本專業培養適應社會主義現代化建設需要，德、智、體、美全面發展，具有良好的科學素養和工程素養，系統掌握計算機硬件、軟件與應用的基本理論、基本知識和基本技能與方法，可從事計算機應用系統開發、設計和集成工作的高級應用型人才。本專業優秀學生可以前往德國、韓國的高等院校攻讀學位。本專業采用“兩段式”人才培養模式，前兩年“重基礎”，即重點完成對學生專業基礎知識和基本技能的培養；后兩年“精方向”，即使學生能在專業方向進行深入學習，并強化對學生工程實踐能力的培養。
主要課程：離散數學、數據結構與算法、編譯原理、操作系統原理、計算機網絡基礎、數字邏輯、計算機組成原理和軟件工程。圍繞提升學生的軟件實現能力、數據庫開發與管理能力和嵌入式系統設計能力，設置了編程語言、數據庫技術和嵌入式系統三大專業核心能力模塊，其中編程語言模塊由包括C（C/C++/C#）和Java(Java/J2EE)兩大主流開發語言的系列課程構成；數據庫技術模塊包含數據庫原理與應用和Oracle數據庫兩門課程；嵌入式系統模塊以微機原理與接口技術、單片機原理與應用、嵌入式系統、嵌入式系統編程、嵌入式Linux內核編程與驅動開發、Android嵌入式軟件開發共六門課程為支撐。
網絡工程專業(本科)
學制：四年授予學位：工學學士
培養目標：本專業培養德、智、體、美全面發展，并具有良好的科學素養和工程素養，掌握計算機網絡系統的基本理論、方法和技術，具有計算機網絡系統設計、開發與集成能力,"“面向一線,"服務地方”的計算機網絡工程師。本專業畢業的學生能夠在政府機構、企事業單位從事計算機網絡系統的設計、開發和管理與維護工作。優秀在校生可以前往德國、韓國的高等院校攻讀學位。
主要課程：程序設計語言、數據結構與算法、Java語言基礎、操作系統原理、數據通信原理、計算機網絡基礎、TCP/IP"協議、網絡工程、信息與網絡安全、網絡系統管理、無線網絡技術、數據庫原理與應用、Web應用系統開發、網絡協議編程、網絡性能測試與分析。
軟件工程專業（本科）實施教育部“卓越工程師教育培養計劃”的專業
學制：四年授予學位：工學學士
培養目標：培養適應我國軟件企業發展需要的，德、智、體、美全面發展，具有良好的思想品質與職業道德、軟件工程意識和素質，富有進取精神和人文精神，具備較強的社會適應能力、工程實踐能力和應用創新能力，能在工程現場從事軟件工程技術應用開發工作，工程功底深厚的軟件工程師。本專業采取“2+1+1”三段式人才培養方案。前2年“重基礎”，即重點完成對學生專業基礎知識和基本技能的培養；三年級“精方向”，即使學生能在特定的專業方向進行深入學習；四年級“強工程”，即在前兩個階段的基礎上，通過項目實訓、企業實訓和畢業設計（論文）等工程實踐環節,強化學生從事工程實踐所需的專業技術能力。
主要課程：離散結構、面向過程程序設計、面向對象程序設計、電路與數字系統設計、數據結構與算法、計算機組成與結構、操作系統、計算機網絡及應用、數據庫原理與應用、編譯原理、軟件工程、軟件測試與質量保證、軟件分析與設計、Web應用系統開發。
計算機科學與技術專業(本科，與德國合作培養)
學制：（2+3）授予學位：國內工學學士德國工學學士
培養目標：本專業培養德、智、體、美全面發展，具有良好的科學與工程素養，系統地掌握計算機硬件、軟件及應用領域的基礎理論和基本技能，能在中德兩國相關行業從事計算機應用系統分析、開發、設計和集成等方面工作的具有中德兩種語言能力的高級應用型人才。
實施方案：本專業人才培養方案按照合肥學院與德國雅德大學兩校合作培養協議，實行“2+3”聯合培養形式，即“雙校園、兩段式、雙文憑”的人才培養模式。前兩年，學生在合肥學院完成基礎德語及相關專業基礎課程的學習；后三年，符合條件的學生前往德國雅德大學進行相關專業學習、畢業實習及畢業論文的撰寫與答辯。學生順利完成學業并達到規定的要求后，可分別獲得兩校頒發的本科畢業證書和學士學位證書。
主要課程（國內部分）：德語、專業德語、高等數學、大學物理、信息技術I、信息技術II、電工電子基礎I等。
網絡系統管理專業（專科，與韓國合作培養）
學制：（1.5+1.5）
培養目標：本專業以“雙校園、兩段式、雙文憑”為人才培養模式，融合中、韓兩國的教育思想和教育理念，發揮中、韓大學的特色和優勢，培養德、智、體、美全面發展，掌握韓語，現代計算機系統的軟、硬件知識，具有計算機網絡組建、管理和維護能力及網絡應用軟件開發能力，適應中韓文化交流、韓資企業及商務機構所需的復合型工程應用人才。
實施方案：本專業人才培養方案按照合肥學院與韓國濟州漢拿大學兩校合作培養協議，實行“1.5+1.5”雙文憑人才培養模式，修完兩校教學計劃規定的課程，成績合格，可獲得兩校頒發的學歷證書。學生前一年半在合肥學院完成基礎韓語及相關專業基礎課程，后一年半經本人申請，考核合格，在韓國濟州漢拿大學完成相關專業課程學習。優秀學生可在韓國升本。
主要課程：韓語、專業韓語、C語言程序設計、數據結構、電路與電子技術、網絡操作系統、電子商務、商務理論、管理信息系統、數據通信原理、計算機網絡基礎、數據庫原理與應用、組網工程、網絡工程、信息與網絡安全、Web應用系統開發、網絡系統管理、移動通信概論、多媒體制作技術、RFID基礎、物流管理、無線網絡技術等。
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