北京航空航天大學高等工程學院創辦于2002年9月。作為北京航空航天大學的高素質人才培養基地和教學改革試驗基地，高等工程學院致力于進一步提高學校教學質量，為國家培養優秀的建設者和領軍、領導人才。肩負高素質人才的塑造者、教育改革創新的先行者、先進人才培養理念的倡導者和空天信融合的踐行者的神圣使命，學院努力提升育人境界，在全新的辦學思想和理念的指導下，依靠精干的管理團隊作為學院的領導和運行核心，依托北航優秀的教師隊伍和科研環境作為學生培養的優勢資源，憑借中關村核心高校區高水平的師資力量作為基礎課程教學的保障條件，深入探索高素質人才培養的客觀規律，不斷完善本科生和研究生教育模式，傾力打造面向高素質工科人才培養的全人教育環境，為堅持走中國特色新型工業化道路輸送合格的建設者和接班人。
在本科教育方面，學院每年從全校新生中擇優選拔40人組建班級，通過實施“通識式基礎教育、漸進式專業教育、開放式實踐教育、自主式發展教育”的四維人才培養模式，推行強化理論基礎、注重工程實踐、面向創新能力培養的全面素質教育，以“一制三化”（即導師制、小班化、個性化、國際化）為特色，注重引導與自發并重、通才與專才結合、知識與能力匹配，努力探索適合北航實際情況的精英人才培養道路。
在大學低年級（一、二年級）階段，學院強調寬基礎的通識培養，著重強化數理基礎，培養綜合素質。在不分專業的通識教育平臺上，引導學生根據個人興趣和能力逐步建立專業認知。通過充分利用地處北京中關村核心高校區的優勢，聘請本校及周邊高校（如北京大學、清華大學、北京師范大學等）最優秀的師資、選用高水平的教材，開設包括數學分析、高等代數、概率統計、數學建模、基礎物理、程序設計、英語、大學語文、中國哲學史、基礎生命科學等基礎課程，為學生打下堅實的理論基礎。
在大學高年級（三、四年級）階段，學院利用北航優秀的教師資源，聘請院士、長江學者、資深博導等擔任學生導師，實現“一生一師”，由所聘導師對學生進行個性化培養，強化學生的實踐能力，指導學生的后續選課計劃及實踐環節的安排，利用導師的科研團隊、實驗室等各種資源培養學生的科研能力。
在重視智力因素培養的同時，學院高度關注非智力因素的培養，以提升學生的綜合素質。通過建立自主式發展教育平臺，引導學生主動參與社會實踐，積極投身社會工作，有效利用校內外各種資源發展興趣愛好，使學生各方面的素質得到充分培養和鍛煉。為了使學生開闊眼界、拓展思路，除定期聘請著名學者作講座、報告外，與國內外知名大學和研究中心建立聯系，組織學生進行短期互訪，或利用學校、學院與一些大學及科研機構的合作協議，制定相應政策，選拔部分學生作中長期的交換培養或合作研究。
為打造培養高水平學術精英和未來業界領軍領導人才的全人教育環境，高等工程學院在十年辦學歷程中不斷改革創新，將博雅教育理念與書院制育人模式科學融合，于2012年秋季建立了“匯融書院”，為培養志存高遠、胸懷天下、嚴謹求實、自由開放的工科精英人才開辟了新的道路。
在研究生教育方面，學校每年從全校直博生中選拔20余名學生進入高等工程學院博士生班（簡稱“高博班”）學習。高博班學制一般為四年，采取以導師制為主，高等工程學院和學生專業所屬院系協助管理的培養方式，通過從京內高校聘請數學、物理學科的知名教授進行小班授課，以保證博士生建立扎實的數理基礎；通過邀請各領域優秀的專家學者進行講座、座談，以優化博士生的學習、研究方法，開闊博士生的視野。學習期間，高博班學員每月享受專門補助，可獲得學校對優秀學生進行國際交流的專項經費支持，并優先享有參加國家留學基金委和教育部聯合主持的博士生國外聯合培養計劃的資格；從三年級開始，高博班學生可以申請學校創新基金的項目支持。高博班執行嚴格的培養計劃，實施年度考核、動態管理，堅持優勝劣汰，以有效的教育管理手段保證人才培養的質量。
十余年來，高等工程學院辦學工作成績斐然：歷屆本科生在課程學習、學科競賽、科技實踐及創新能力方面均獲得了廣泛認可，表現出良好的發展潛力；本科畢業生中，保研或直博比例超過70%，直接出國及考取國內名校研究生比例超過20%，在培養過程中具有國際一流大學學習經歷的學生比例超過30%；已招收的百余名博士生全部參與了國家“973”計劃、“863”計劃、國家自然科學基金等重要課題研究任務，表現出了良好的原始創新潛能。學院在教育教學改革中積累的經驗，為北航進一步提升高素質創新型人才培養水平打下了堅實的基礎。
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