水產養殖專業為廣東省名牌專業，國家特色專業建設點，水產養殖學科為省級重點學科，本專業具有碩士學位授予權。
（1）水產經濟動植物增養殖方向
培養目標：培養具有堅實的生物學和水域環境科學的基礎理論知識，掌握水產經濟動植物增養殖的基本理論、基本知識和基本技能，具有從事內陸水域和淺海水產經濟動植物增養殖、病害防治及相關專業的生產、經營、管理、教學和研究開發能力的高級水產科學技術人才。本科學制四年。
主要課程：動物學、水生生物學、魚類學、海產經濟無脊椎動物生物學、組織胚胎學、魚類生理學、微生物學、遺傳育種學、生物化學、生態學、淺海海洋學、水化學與水質管理、淡水經濟動物增養殖學、海產經濟動物增養殖學、海藻與海藻栽培學、生物餌料培養、水產養殖工程學、水產動物病害防治學、水產動物營養與飼料學、企業經營管理學等。
（2）水產經濟動物病害防治方向
培養目標：培養具有堅實的生物學和水域環境科學的基礎理論知識，掌握水生經濟動物病害監測、疾病診斷與防治的基本理論、基本知識和基本技能，具有從事水產經濟動物病害防治、水產藥物、水產養殖及相關專業的生產、管理、教學和研究開發能力的高級水產科學技術人才。本科學制四年。
主要課程：動物學、水生生物學、魚類學、海產經濟無脊椎動物生物學、組織胚胎學、魚類生理學、微生物學、遺傳育種學、生物化學、生態學、淺海海洋學、水化學與水質管理、水產增養殖學、水產動物營養與飼料學、水產動物病害防治學、病毒學、細菌分類學、病理學、免疫學、水產藥物與藥理學、企業經營管理學等。
（3）水產動物營養與飼料方向
培養目標：培養具有堅實的生物學和水域環境科學的基礎理論知識，掌握水產動物營養、飼料加工工藝與技術的基本理論、基本知識和基本技能，具有從事水產動物飼料、水產養殖及相關專業的生產、管理、教學和研究開發能力的高級水產科學技術人才。本科學制四年。
主要課程：動物學、水生生物學、魚類學、海產經濟無脊椎動物生物學、組織胚胎學、魚類生理學、微生物學、遺傳育種學、生物化學、生態學、淺海海洋學、水化學與水質管理、水產增養殖學、水產動物病害防治學、水產動物營養學、生物餌料培養、飼料學、飼料加工工藝與設備、飼料檢測與分析、飼料添加劑、企業經營管理學等。
本專業從第三學年起，學生可根據社會的需求和本人意愿，在以上三個專業方向中選擇一個專業方向。
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