麻醉學院成立于2013年7月，現有麻醉學、遺傳學碩士學位授權點各一個，麻醉學本科專業為省級特色專業。下設臨床麻醉與危重病學教研室和麻醉學專業實驗中心；在校學生1010人。
歷史沿革：
麻醉學專業的發展最早追溯到1980年，我校蔣紹祥教授在省內舉辦了首屆麻醉醫師培訓班，以后逐年舉辦，培養了一批具有麻醉專業知識的專門人才，以適應我省醫學快速發展的需要。
1993 -1994年，招收兩屆麻醉學（方向）專科生；
1996年11月，向省教委申報增設麻醉學專業（本科）；
1997－1998年，招收兩屆麻醉學（方向）本科生；
1999年1月，教育部批準我校設置麻醉學本科專業（高教函〔1999〕2號）；
1999年5月，皖南醫學院成立麻醉系籌備組，同年成功申報“安徽省重點建設專業”；
2000年7月，皖南醫學院正式成立麻醉系；
2005年7月，系部調整，麻醉學專業、醫學影像學專業、醫學美容（專科）專業并入同一個系管理，更名為醫學技術系；
2007年11月，皖南醫學院系部整合，麻醉學專業、醫學影像學專業并入同一個系管理，更名為醫學二系；2012年招收生物醫學工程（本科）專業；
2013年7月，皖南醫學院成立麻醉學院。
師資隊伍：
現有專業教師26人，其中正高職稱（教授、主任醫師）7人、副高職稱（副教授、副主任醫師）4人、中級職稱（講師、主治醫師）8人；博士 1 人 、碩士 12 人；省級學術技術帶頭人1人，省級學術技術帶頭人后備人選1人；有2人分別承擔安徽省麻醉專業學會、安徽省危重病學會、安徽省疼痛學會副主任委員；1人獲省級教壇新秀，7人次先后獲得皖南醫學院優秀教師；先后有3人次參加教育部舉辦《全國高校骨干青年教師培訓班》，1人作為國內訪問學者赴華西醫科大學習一年，1人作為《教育部高校青年骨干教師國內訪問學者》赴上海交大醫學院學習十個月，1人赴美國德州心血管醫院學習，1人作為國外訪問學者赴德國伍珀塔爾心臟中心學習。
教學成效：
近5年來，在金孝岠教授帶領下，麻醉學專業的教學改革取得豐碩成果，先后獲得：
2009年，獲省級麻醉學專業復合型人才培養創新實驗區；
2010年，獲省級特色專業；
2012年，獲省級麻醉學專業綜合改革試點；
2013年，獲國家級麻醉學專業綜合改革試點。
碩士點建設：
研究生教育起步早，1986年蔣紹祥教授與汪桐教授聯合招收“中西醫結合碩士研究生”，1987年開始培養麻醉學碩士研究生；省立醫院陳昆洲教授亦在我校聯合招收培養麻醉學專業研究生2人。
2003年被批準為麻醉專業碩士學位授權點，當年碩士生導師為張鶴、劉正德、金孝岠；2005年新增碩士生導師戴澤平、柳兆芳；2007年新增碩士生導師陳永權、劉小彬；2011年新增碩士導師魯衛華、郭文俊；寧波李惠利醫院、解放軍454醫院、上海第五人民醫院為我校碩士生聯合培養點；現有麻醉學專業碩士生導師10人（包括聯合培養點），截至2013年已培養碩士研究生73人。
科學研究：
近年來獲得省衛生廳、省教育廳等各類科研基金20多項，在SCI、國家重點核心期刊、國家級期刊等發表論文100多篇，參與編寫專著10部，省教育廳課題“全麻病人麻醉誘導藥物優化配伍方案”通過省級成果鑒定，獲2008年度省科技三等獎，自選課題“血液稀釋技術的基礎與臨床”獲2010年度省科技三等獎。“星狀神經節阻滯在麻醉中應用”獲2012年度蕪湖市科技進步三等獎。
學術交流：
每年邀請著名專家、學者前來講學、交流。
華中科大協和醫院副院長、麻醉醫師協會會長姚尚龍教授；麻醉醫師協會前任會長、北京協和醫院黃宇光教授；江蘇省麻醉學會前主任委員、南京軍區總醫院麻醉科主任徐建國教授；全國麻醉學會主任委員、華西醫院麻醉科主任劉進教授；候任麻醉醫師協會會長、上海市麻醉學會主任委員、東方肝膽醫院麻醉科主任俞衛峰教授；江蘇省麻醉學會主任委員、江蘇省人民醫院麻醉科主任丁正年教授等應邀前來講學。
從2005年來已連續舉辦八期國家級繼續教育學習班。
畢業生就業：
截至2013年7月，已培養麻醉學專業畢業785人，連續12年就業率達100%，大多被三級醫院聘用；有的已成為省市級醫院麻醉科、ICU、急診科的學科帶頭人或業務骨干。
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