土木工程學院前身為建筑工程系，2002年更名為土木工程系，2006年升格為土木工程學院。土木工程專業是安徽建筑工業學院1958年創辦時期的第一個本科專業，前身為工業與民用建筑專業。自1958年招收第一屆五年制工業與民用建筑專業學生以來，已為國家、地方培養和輸送土建類專業技術與管理人才6000余人。
土木工程學院現有土木工程、安全工程、勘查技術與工程、測繪工程、交通工程、道路橋梁與渡河工程、地質工程7個本科專業，在校本科生3300余人。擁有土木工程一級學科碩士學位授權點；結構工程、工程力學、巖土工程、防災減災與防護工程、橋梁與隧道工程5個二級學科碩士學位授權點、建筑與土木工程領域工程碩士學位授權點。土木工程專業先后于2003年被評為安徽省教改示范專業、2007年通過國家住房與城鄉建設部全國高等教育土木工程專業評估、2008年被列為國家級特色專業建設點、2012年被教育部確定為第二批卓越工程師教育培養計劃試點專業，土木工程學科2009年被列為安徽省博士學位授予權立項建設學科，結構工程2008年被列為省級重點學科，防災減災工程與防護工程于2012年被列為省級重點學科。
學院現有專任教師110人，具有正高28人（其中教授25人），副高48人（其中副教授34人）；具有博士學位33人、碩士學位48人；博士生導師3名，碩士生導師31名。其中：國家級教學名師1名，安徽省教學名師3名；國家“百千萬人才工程”專業拔尖人才1人；全國先進工作者1名；全國模范教師1名；全國優秀教師2名；省優秀教師2名；安徽省學術與技術帶頭人2人、后備人選1人；安徽省建筑勘察設計大師1名；享受國務院和安徽省政府特殊津貼3人。擁有國家級教學團隊1個，省級教學團隊2個，省級科技創新團隊1個。
土木工程學院現有建筑結構與地下工程安徽省重點實驗室、建筑能耗控制與評估教育部工程研究中心、建筑健康監測及災害預防技術安徽省工程實驗室、建筑節能安徽省工程技術研究中心；設有建筑工程系、工程力學系、巖土工程系、道路與橋梁工程系、安全工程系5個專業系，巖土工程、建筑結構、安全工程、工程力學、防災減災、工程測繪6個研究所，以及土木工程綜合實驗中心。土木工程綜合實驗中心包括結構、土工、沖擊動力學、凍土等8個實驗室，建筑面積4367㎡，固定資產2780萬元。學校圖書館在土木工程設有分館，藏有專業圖書約5828冊，長期訂閱國內外期刊68種。
土木工程學院先后與德國德累斯頓工業大學、美國伊利諾依理工學院、香港理工大學、中國科學技術大學、同濟大學等多所國內外高校建立了友好合作關系，開展教學與科研工作。與此同時，土木工程學院還利用自身專業優勢，積極參與地方經濟建設活動，承擔了大量的工程勘察、測繪、設計、檢測、加固和施工技術研發等工作，解決了許多實際工程難題，受到了社會廣泛好評。
五年來，土木工程學院共承擔各類科研課題近160項，其中國家級16項（國家自然科學基金7項），縱橫向課題經費3500余萬元。獲各類科研獎勵47項、專利5項，其中：國家科學進步獎二等獎2項，省（部）級科技進步獎一等獎2項、二等獎5項、三等獎5項，中國行業協會科學技術進步獎特等獎1項、一等獎1項；另有國家優秀教學成果獎二等獎1項，安徽省優秀教學成果獎特等獎1項、一等獎1項、二等獎2項、三等獎1項。發表學術論文近400篇，其中SCI、EI、ISTP收錄121篇。擁有國家級精品課程1門、省級精品課程8門；出版專著3部、省級規劃教材26部。
發展是興院強院第一要務。土木工程學院將繼續堅持“以教學質量立校，科研實力強校”的辦學理念，堅持以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，深入貫徹科學發展觀，解放思想，深化改革，開拓創新，加快發展，全面提升教育教學質量和人才培養質量，努力把土木工程學院辦成在全國具有鮮明特色、影響較大的工科類學院。
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