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醫學院始建于1952年，初建為張掖衛校，2003年4月經教育部批準改建為張掖醫學高等專科學校。2014年3月，經教育部、甘肅省政府批準張掖醫學高等專科學校整體并入河西學院后成立河西學院醫學院。
學院現有臨床醫學、護理學、醫學影像技術、藥學四個本科專業，臨床醫學、護理、醫學影像技術、藥學、助產、針灸推拿、中醫、口腔醫學技術、康復治療技術和醫學檢驗技術10個專科專業；已建設省級特色專業1個，省級精品課程2門。學院生源充足，錄取新生均為第一志愿，且錄取分數超過省控分數線90分以上，新生報到率連續數年保持在90%以上；現有在校生 6000余人。畢業生就業率穩中有升，畢業生就業率保持在90%以上。
學院現有教職工279人，教授10名，副教授46名，具有研究生以上學歷教師45名；省級教學團隊2個，省級教學名師1名，教師和學生多次在全國及省級教學比賽和專業技能比賽中獲獎。近年來，學院教師承擔校級以上科研項目13項，在省級以上刊物發表論文677篇，主參編教材、教學參考書及專著156部，獲地廳級以上教學、科研成果獎勵32項。
學院非常重視實踐教學基地建設，現有校內實驗實訓室40余個，面積17000多平方米，共有設備3000余臺套件，設備總值2000余萬元；以河西學院附屬張掖人民醫院為中心，積極與各校外臨床教學基地進行廣泛的交流與合作，建立了能滿足各專業實習、見習需要的、穩定的臨床教學基地，為提高學生實踐動手能力提供了良好的環境，保證了學生后期臨床教學質量。到目前為止，臨床教學基地總數已達60余個，形成了以2所直屬附屬醫院為中心、2所非直屬附屬醫院為主干、60多家教學實習醫院為支撐的臨床教學與實習基地群。
學院2004年被教育部、衛生部等六部委確定為全國護理領域技能型緊缺人才培養培訓基地，2005年被甘肅省衛生廳確立為“全科醫學”培訓基地，2006年被甘肅省衛生廳確立為“鄉村醫生”專科學歷培訓基地。
臨床醫學專業
學制學歷：五年制本科
培養目標：培養適應醫藥衛生事業發展需要，具有良好職業素養、初步臨床工作能力和終身學習能力，能在各級衛生保健機構從事醫療工作的應用型人才。
主要課程：人體解剖學、組織胚胎學、生理學、生物化學、病理學、藥理學、診斷學、內科學、外科學、婦產科學、兒科學、預防醫學等。
就業方向：在醫療衛生單位、醫學科研等部門從事醫療及預防、醫學科研等方面的工作。
護理學專業
學制學歷：四年制本科
培養目標: 培養具備較系統的護理及相關醫學和人文社會科學知識，具有基本臨床護理能力、初步的教學能力、管理能力、研究能力以及良好的職業素養，能在各類醫療衛生保健機構從事護理工作的應用型人才。
主要課程：人體解剖學、基礎生理學、藥理學、病原生物學、健康評估、護理學基礎、內科護理學、外科護理學、婦產科護理學、兒科護理學、精神科護理學、社區護理學、護理管理學及護理倫理學等。
就業方向：在各級各類綜合醫院、專科醫院、急救中心、康復中心、社區醫療服務中心從事臨床護理、護理管理工作。
藥學專業
學制學歷：四年制本科
培養目標: 培養具備藥學學科基本理論、基本知識和一定實驗技能，能夠在藥學領域從事藥物研究與開發、藥物生產、藥物質量控制、藥物臨床應用和監督管理等方面工作的藥學專門人才。
主要課程：有機化學、分析化學、物理化學、生物化學、人體解剖生理學、微生物學與免疫學、藥物化學、天然藥物化學、生藥學、臨床醫學概論、藥劑學、藥理學、藥物分析、藥事管理學等。
就業方向：在藥學領域醫院、制藥廠和醫藥研究所從事藥物研究與開發、藥物生產、藥物質量控制、藥物臨床應用和監督管理等方面的工作。
醫學影像技術專業
學制學歷：四年制本科
培養目標: 培養具備扎實影像技術工作的基本能力和技能，能在醫學影像技術專業領域從事醫學影像學檢查、放射治療技術、醫學影像設備的管理維護等工作的應用型人才。
主要課程：影像應用數學、影像物理學、圖像處理算法基礎、醫學影像設備學、醫學影像成像原理、醫學圖像處理、醫學影像設備安裝與維修、醫學影像檢查技術、醫學影像診斷學等。
就業方向：在各級醫院從事醫學影像檢查、影像設備維修和放射治療等方面的工作。
臨床醫學專業
學制學歷：三年制專科
培養目標：為城鄉、社區等基層醫療機構培養掌握基礎醫學、臨床醫學的理論和基礎技能，具有醫療、康復、預防保健及計劃生育等方面工作能力的高素質技能型醫療人才。
主要課程：人體解剖與組胚學、生理學、生物化學、病理學、病原生物與免疫學、藥理學、診斷學、外科學、內科學、婦產科學、兒科學、預防醫學等。
就業方向：在城鄉、社區等基層醫療衛生機構從事醫療、預防、保健工作。
康復治療技術專業
學制學歷：三年制專科
培養目標：培養掌握康復治療技術專業必需的基本理論知識和專業技能，具有良好的職業道德、人文素養、實踐能力和創新精神，畢業后能從事康復治療技術和康復保健的應用性高級技術人才。
主要課程：解剖與組織胚胎學、生理學、藥理學、病理學、中醫基礎理論、中醫診斷學、臨床醫學概要、中醫臨床概要、康復評定學、針灸推拿學、中醫傷科學、中醫筋傷學、康復醫學概要、康復評定學、康復治療技術、臨床康復學、康復工程學、中醫養身康復學等。
就業方向：康復機構及各級醫院康復科、康復保健機構。
醫學影像技術專業
學制學歷：三年制專科
培養目標：為城鄉、社區等醫療衛生機構培養具有醫學影像技術基本理論和基本技能，能夠從事醫學影像技術工作的高素質技能型專門人才。
主要課程：醫學影像成像原理、人體解剖學、斷面解剖學、影像電子學基礎、病理學、診斷學、內科學、外科學、醫學影像設備學、X線診斷學、醫學影像檢查技術、CT攝影與診斷技術、MRI診斷學、超聲診斷技術、計算機應用基礎等。
就業方向：在城鄉、社區等基層醫療衛生機構從事醫學影像設備的操作、維修、營銷以及其他與醫學影像技術相關的工作領域。
藥學專業
學制學歷：三年制專科
培養目標：培養適應社會經濟發展和崗位需要，從事藥品經營、生產、檢驗、流通、鑒定、制劑等工作的高素質技能型專門人才。
主要課程：無機化學、有機化學、分析化學、生物化學、藥物化學、天然藥物化學、藥用植物學、藥劑學、生藥學、藥理學、藥物分析、藥事管理學、醫藥市場營銷學等。
就業方向：城鄉、社區等基層醫療衛生機構、藥廠以及其他與藥學有關的工作領域。
針灸推拿專業
學制學歷：三年制專科
培養目標：培養適應醫藥衛生事業發展需要，具備中醫基本理論與針灸推拿技能，在城鄉、社區等基層醫療衛生機構從事針灸、推拿工作的高素質技能型專門人才。
主要課程：人體解剖學、生理學、診斷學基礎、中醫學基礎、中醫診斷學、中藥學、方劑學、中醫內科學、中醫外科學、中醫傷科學、西醫內科學、針法灸法學、經絡腧穴學、推拿練功學、推拿手法學、推拿治療學、針灸治療學等。
就業方向：面向城鄉、社區等基層醫療衛生機構，能夠從事針灸推拿醫療工作以及與針灸推拿專業有關工作領域。
中醫學專業
學制學歷：三年制專科
培養目標：培養具有一定中醫基礎知識和基本技能的高素質技能型中醫臨床專門人才。
主要課程：人體解剖學、生理學、病原生物和免疫學、藥理學、病理學、中醫基礎理論、中醫診斷學、中藥學、方劑學、西醫診斷學、中醫內科學、中醫外科學、中醫婦科學、中醫兒科學、針灸推拿學、中醫傷科學、西醫內科學、西醫外科學等。
就業方向：面向城鄉、社區等基層醫療衛生機構，能夠從事中醫臨床各科醫療工作以及與中醫學專業有關工作領域。
助產專業
學制學歷：三年制專科
培養目標：培養掌握現代護理及母嬰保健知識和技能，適應崗位需求，從事臨床助產、母嬰保健、護理等工作的高素質技能型專門人才。
主要課程：人體解剖與組胚學、病理學、藥理學、護理學基礎、健康評估、內科護理學、外科護理學、婦科護理學、產科護理學、兒科護理學、母嬰保健、預防醫學等。
就業方向：醫院、社區、鄉鎮以及其他與助產有關的醫療衛生工作領域。
醫學檢驗技術專業
學制學歷：三年制專科
培養目標：培養面向城鄉基層醫療衛生機構，掌握醫學檢驗基本理論和專業技能，能夠從事醫學檢驗技術工作的高素質應用型專門人才。
主要課程：人體解剖與組織學、生理學、病理學、醫學細胞生物學、生物化學、醫學統計學、醫學免疫學、病原生物學、分析化學、檢驗儀器學、臨床檢驗基礎、病原生物學檢驗、免疫學檢驗、血液學檢驗、生物化學檢驗、實驗室管理學等。
就業方向：在城鄉、社區等基層醫療衛生機構，從事醫學檢驗技術工作。
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