①尿素合成減少：
氨清除不足。肝性腦病時血氨增高的主要原因是由于肝臟鳥氨酸循環障礙。肝功能嚴重障礙時，一方面由于代謝障礙，供給鳥氨酸循環的ATP不足;另一方面，鳥氨酸循環的酶系統嚴重受損;以及鳥氨酸循環的各種基質缺失等均可使由氨合成尿素明顯減少，導致血氨增高。
②氨的產生增多：
血氨主要來源于腸道產氨。肝臟功能嚴重障礙時，門脈血流受阻，腸粘膜淤血，水腫，腸蠕動減弱以及膽汁分泌減少等，均可使消化吸收功能降低，導致腸道細菌活躍，一方面可使細菌釋放的氨基酸氧化酶和尿素酶增多;另一方面，未經消化吸收的蛋白成分在腸道潴留，使腸內氨基酸增多;肝硬化晚期合并腎功能障礙，尿素排除減少，可使彌散入腸道的尿素增加，使腸道產氨增加。如果合并上消化道出血，由于腸道內血液蛋白質增多，產氨增多。
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