賬套管理包括賬套的建立、修改、引入和輸出。其中，系統管理員有權進行賬套的建立、引入和輸出操作，而賬套信息的修改則由賬套主管負責。
(1)建立賬套。建立賬套是企業應用會計信息系統的首要環節，其中涉及很多與日后核算相關的內容。為了方便操作，會計信息系統中大都設置了建賬向導，用來引導用戶的建賬過程。建立企業賬套時，需要向系統提供以下表明企業特征的信息，歸類如下：
賬套基本信息：包括賬套號、賬套名稱、賬套啟用日期及賬套路徑。
核算單位基本信息：包括企業名稱、簡稱、地址、郵政編碼、法人、通訊方式等。
賬套核算信息：包括記賬本位幣、行業性質、企業類型、賬套主管、編碼規則。數據精度等。
(2)修改賬套。賬套建立完成后，如果發現有些參數有誤需要修改，或者希望查看建賬時所設定的信息，可以執行賬套修改功能。只有賬套主管有權修改賬套，即便如此，有些系統已使用的關鍵信息仍無法修改，如賬套號、啟用會計期。
(3)引入和輸出賬套。賬套輸出是將系統產生的數據備份到硬盤、軟盤等存儲介質。引入賬套功能是指將系統外某賬套數據引入本系統中。
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