由于企業參與了不同形式的保理業務，因此它所進行的賬務處理也不同。無論采用哪種方式進行保理業務的賬務處理，企業都應當設置“庫存現金”、“銀行存款”、“應收賬款”、“壞賬準備”、“財務費用”、“管理費用”等賬戶。
（一）有追索權保理的賬務處理
有追索權的保理相當于是將應收賬款質押給了銀行，從而獲取融資。銀行有追索權，因此企業并沒有將相應的風險進行轉移。
轉讓的時候
借：銀行存款（按實際收到的款項）
財務費用（按辦理保理業務時繳納的手續費）
貸：短期借款
如果企業銷售的這批貨物發生了退回，則記
借：主營業務收入
財務費用
應交稅費——應交增值稅（銷項稅額）
貸：應收賬款
到期時，如果購貨商能完全支付掉貨款，則
借：短期借款
貸：應收賬款
若到期銀行收不回貨款，由于銀行附有追索權，則企業就有義務償還相應的費用。
借：短期借款
貸：銀行存款
（二）無追索權保理的賬務處理
無追索權相當于企業將應收賬款進行了買斷，企業應將所出售的應收債權予以轉銷，結轉計提的相關壞賬準備，確認預計可能發生的銷售退回、銷售折扣、現金折扣等，確認開展保理的損益。
轉讓時，
借：銀行存款（實際收到的款項）
營業外支出
其他應收款（預計將發生的銷售折扣和折讓）
壞賬準備（保理業務中應收債權已經提取的壞賬準備）
財務費用（支付的保理手續費）
貸：應收賬款
營業外收入
實際發生銷售的退回和折讓
借：主營業務收入
財務費用
應交稅費——應交增值稅（銷項稅額）
貸：其他應收款
（三）明保理和暗保理的會計處理與有追索權和無追索權保理的賬務處理相同。
（四）融資保理是按照發票金額的80%獲得銀行的融資，余下的20%應收賬款等到保理商向購貨商全部收回應收賬款以后，保理商再向供貨商結清應收賬款。它的會計處理是按照有追索權和無追索權的保理進行處理。
到期保理中供貨商，企業只在到期后做相應的處理：
借：銀行存款（實際收到的貨幣資金）
財務費用（實際收到的貨幣資金與應收賬款價值的差額）、
壞賬準備（已計提的壞賬準備）
貸：應收賬款（應收賬款的賬面價值）
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