| 單位名稱 | 單位性質 | 單位地址 | 主要職能 |
| 作物研究所 | 全額撥款事業單位 | 成都市獅子山路4號 | 農作物遺傳育種、耕作栽培等研究與應用 |
| 土壤肥料研究所 | 全額撥款事業單位 | 成都市獅子山路4號 | 土壤、肥料、農業微生物、資源環境等研究與應用 |
| 植物保護研究所 | 全額撥款事業單位 | 成都市凈居寺路20號 | 農作物病、蟲、草、鼠防控技術及品種抗性評價等 |
| 遙感應用研究所 | 全額撥款事業單位 | 成都市凈居寺路20號 | 土地資源調查及農作物的生長監測與評估 |
| 農業信息與農村經濟研究所 | 全額撥款事業單位 | 成都市凈居寺路20號 | 農業咨詢、信息資源建設與網絡服務、期刊編輯及農村經濟研究 |
| 分析測試中心 | 全額撥款事業單位 | 成都市凈居寺路20號 | 農產品質量檢驗、檢測技術方法研究和相關標準的制修訂 |
| 茶葉研究所 | 全額撥款事業單位 | 成都市凈居寺路20號 | 茶學科研及應用 |
| 農產品加工研究所 | 全額撥款事業單位 | 成都市獅子山路4號 | 農產品加工、農業科研基地管理及服務、農機科研 |
| 服務中心 | 全額撥款事業單位 | 成都市凈居寺路20號 | 農業工程科研、后勤、幼兒教育等服務 |
| 水稻高粱研究所 | 全額撥款事業單位 | 總部：德陽市旌陽區玉泉路508號 分部：瀘州市大驛壩4號 | 水稻、高粱良種良法研究及其推廣應用 |
| 經濟作物育種栽培研究所 | 全額撥款事業單位 | 成都市青白江區華金大道三段159號 | 棉、蔬、藥材等作物品種選育、栽培、植保研究 |
| 蠶業研究所 | 全額撥款事業單位 | 南充市儀鳳街108號 | 蠶桑、牧草研究及綜合應用 |
| 水產研究所 | 全額撥款事業單位 | 總部：成都市高新西區西源大道1611號 分部：宜賓市高莊橋 | 漁業資源研究開發及咨詢、品種選育、繁殖及養殖 |
| 院機關（研究開發中心） | 全額撥款事業單位 | 成都市凈居寺路20號 | 科技交流和推廣服務等 |
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