為適應研究型大學建設要求，培養(yǎng)優(yōu)秀拔尖創(chuàng)新型高素質人才，學校設立了金善寶實驗班。實驗班是本碩連讀優(yōu)秀人才培養(yǎng)計劃班，主要有經濟管理、植物生產和動物生產三類學科專業(yè)。實驗班從每年新生中通過考試擇優(yōu)選拔，按照“3+3”貫通本科和研究生教育的培養(yǎng)模式開展教育教學工作。學生在前3個學年按“加強基礎、拓寬專業(yè)面”的原則完成本科階段教學，經滾動和終選，被確定為本碩連讀的學生后3個學年可選擇專業(yè)方向，直接進入研究生階段學習。
金善寶實驗班(經濟管理類)：依托南京農業(yè)大學農業(yè)經濟管理和土地資源管理兩個國家級重點學科在科學研究和人才培養(yǎng)方面的優(yōu)勢和條件而設立，對拔尖人才進行重點培養(yǎng)，因材施教，鼓勵個性發(fā)展和特長發(fā)揮。實驗班課程單獨設置，以創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)和國際化為目標，突出創(chuàng)新性和復合性;以實體班形式運行，全程實行學分制教學管理，科學有效。
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