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生物與食品工程學院的前身是滁縣師范學校的理化組，歷經化學系、化學生物系、化學與生命科學系，2011年7月，為適應人才培養和學科發展需要，成立生物與食品工程學院。現開設生物科學、食品質量與安全、園林、食品科學與工程四個本科專業，共有在校學生600余人。

學院師資力量雄厚，現有教職工28人，其中教授6人、副教授6人、高級實驗師1人，具有博士學位12人，碩士8人，在讀博士2人。學院教師積極開展科學研究，培養學生創新能力，服務地方經濟發展。近年來，共主持各類項目50多項，其中國家自然科學基金2項、國家星火計劃項目1項，省部級項目8項，廳局級項目25項，產學研合作項目30多項。在生態養殖、蝴蝶分類、草業科學、特色農產品活性成分提取、遺傳育種等方面形成了特色，獲發明專利2項，發表論文260余篇。

學院擁有PX2梯度PCR儀、3000PECA-LVD電泳儀（含電泳槽）、BIO-PRINT凝膠成像系統、超低溫冰箱、冷凍高速離心機和MICROMAX VENTLLATED小型高速離心機、原子吸收分光光度計、近紅外光譜儀、離子色譜儀等儀器設備，復合茶飲料中試生產線和微生物發酵系統為學生提供了便利的實習實訓條件。

學院致力于培養專業基礎知識扎實、技術應用能力出眾，能在相關領域從事研究開發、管理或教育教學工作的高素質應用型人才。與世界500強之一的嘉吉公司合作開設的“嘉吉班”，開創了校企合作共同培養人才的新模式，有利于提高學生綜合素質、實現直接就業。

學院注重學生的創新創業能力培養，校企聯合在各個專業舉辦“創意杯”技能競賽，近兩年來學生先后獲第十二屆全國大學生課外學術科技作品競賽三等獎1項，安徽省第四屆“挑戰杯”大學生課外學術科技作品競賽一等獎1項，第五屆“挑戰杯”安徽省大學生創業計劃競賽優秀獎1項，安徽省“綠色生活，有你有我—生態環保系列活動”一等獎1項，發表學術論文6篇，滁州學院大學生科研立項獲批18項，2012年度國家級大學生創新創業訓練計劃項目10項。畢業生頗受社會歡迎，近5年一次就業率始終保持在99%以上，2009年本科生考研報名率為47.4%，上線率45%；2010年本科生考研報名率為47.5%，上線率56.9%。2011年本科生考研報名率為47.4%，上線率52.8%。2012年本科生考研報名率為57.4%，上線率51.4%。2008、2009、2010連續三年獲校教學科研考核工作第一名，多次獲思政和黨建工作先進單位以及省大中專學生志愿者暑期“三下鄉”社會實踐活動和共青團工作先進單位等稱號。

食品質量與安全專業（本科，省級特色專業建設點，省級特色農產品深加工與質量控制工程實踐中心）

培養目標：培養適應社會主義現代化需要的德、智、體、美全面發展，具有一定的食品質量與安全專業理論基礎、理論應用和技術應用能力，能在食品生產、加工、質檢、環保、外貿等領域從事有關食品質量與安全工作的標準制定、檢測檢驗、認定認證的高素質應用型專門人才。

主要課程：無機及分析化學、有機化學、儀器分析、生物化學、食品化學、食品微生物學、食品質量安全概論、食品營養與衛生、食品檢驗、食品質量管理體系、食品標準與法規、現代分析檢測技術、環境監測與評價、食品安全認證、農產品GAP生產技術等。

就業方向：在農產品質量檢測中心、食品生產企業、質量監督局、檢驗檢疫局、海關、工商行政、學校等單位從事質量檢驗控制、標準化和認證、食品加工、科學研究、教育教學、營養保健工作。