醫學檢驗技術專業為省級特色專業。自1955年起籌辦中等醫學檢驗專業，1956年招收檢驗專業中專生，1971年由合肥下遷到巢湖市，成立巢湖地區衛生學校。2002年，原巢湖衛校、巢湖農校與巢湖財校三校合并成立了巢湖職業技術學院，同年7月，正式開設了高職醫學檢驗技術專業。半個多世紀以來，為我省乃至全國各級醫療衛生機構培養了約6000余名大中專檢驗專業方面的人才。他們中很多人成為檢驗學科的帶頭人，一些人成為醫院管理者，數百人成為碩士、博士，在高校、科研機構成為教授或研究員，有的甚至是國內檢驗醫學界的權威專家，被稱為安徽省“醫學檢驗專業人才的搖籃”。
專業設置與定位：醫學檢驗技術專業學制三年，招收高中畢業和衛生類中職畢業生。專業定位于面向本省、輻射周邊，立足基層、面向縣級及以下醫療衛生機構；培養下得去、用得上、留得住并且有一定的轉崗能力和發展潛力的高素質技能性醫學檢驗人才。
培養目標：檢驗專業培養擁護黨的基本路線，德、智、體、美、勞全面發展的，掌握醫學檢驗基本理論知識，具有熟練的醫學檢驗操作技能和運用所學知識分析、解決實際問題的能力，誠實、守信，具備良好的職業道德和一定的人文素養，畢業后能在各級各類醫院、血站、疾病控制中心及藥物質量檢驗等部門從事醫學檢驗或醫學類實驗室工作的高素質技能性醫學檢驗人才。
師資力量：檢驗專業教學團隊共有35名教職工，副高及以上職稱8人，講師27人，碩士學歷學位教師5人，省級專業帶頭人1名,院級專業帶頭人2名。省級精品課程1門，院級精品課程2門。
主要課程：有《人體寄生蟲學及檢驗技術》、《免疫學及檢驗技術》、《臨床檢驗基礎》、《生物化學及檢驗技術》、《血液學及檢驗技術》、《微生物學及檢驗技術》和《衛生理化檢驗技術》等7門課程。
校內、外實訓條件：專業技術課實驗實訓室7個，職業基礎課實驗室5個，大型精密儀器室1個，約400余萬元的大型教學科研設備,如全自動生化分析儀、尿液分析儀、血球分析儀、熒光顯微鏡、酶標儀等。擁有省內外實習基地40多家，其中省內實訓基地30余家，主要有省立醫院、合肥市第一人民醫院、蕪湖弋磯山醫院、巢湖市第一人民醫院等；省外10余家，主要有江蘇省中醫院、江蘇省中西醫結合醫院、上海市第八人民醫院、上海市市北醫院等。這些校外實訓實習基地較好地滿足了本專業學生在校見習、臨床實習的需求。
就業崗位：城鄉各級醫院檢驗科、社區衛生服務站、醫學檢驗中心等核心就業崗位群，以及輸血檢驗、病理檢驗、衛生檢驗、獨立醫學實驗室、醫療器械生產企業等崗位就業群。
新生報到率、畢業生就業率和學生滿意度：醫學檢驗技術專業新生報到率一直保持較高水平。2007年、2008年學生報到率分別是91%和100%；2007屆畢業生210名，就業率96%，2008屆畢業生219名，就業率95%，2009屆畢業生215人，目前就業率已達到100%。
畢業生遍布我省各縣市鄉鎮衛生單位，以及周邊省市部分醫療衛生單位，普遍反映良好，特別是學生的崗位敬業精神、學習積極性、動手能力和學習態度。用人單位滿意度達95%。這一方面證明了檢驗專業培養方案的可行性、正確性；另一方面也為培養方案的繼續完善提供了依據，使得培養出來的學生更能適應社會的需要。
醫學檢驗技術專業緊密結合國家、區域經濟社會發展需要推進專業建設，依托現有學科平臺，傳承優秀辦學傳統，通過調整專業建設思路、改革人才培養模式，優化專業結構，提高了人才培養質量，辦出了專業特色。一直堅持強化實踐教學，重視學生校內學習與實際工作的一致性，校內成績考核與醫院檢驗科出科實踐考核相結合，實現課堂與實習地點的一體化，并建立了相對獨立的實踐教學和考核體系。
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