湖北中醫藥大學體育部成立于2004年,是學校體育教學工作的職能部門。體育部以《全國普通高等學校體育課程教學指導綱要》為指導，全面貫徹實施《學生體質健康標準》，在學校黨委及主管領導的直接領導下，本著“育人為本、全面發展、弘揚傳統、爭創一流”的工作方針，主要承擔學校公共體育課程的教學、校內外的體育競賽人才的培養、學校體育對外交流等工作任務。
體育部目前形成了一支以中青年教師為主體、具有較高學術素養和教學水平、職稱結構合理、學緣結構優化，充滿活力與朝氣的師資隊伍。目前共有專職教師27人，其中副教授9人；具有博士、碩士學位的教師15人，占教師總數的55%；高學歷中青年教師達90%以上。
按照學校辦學思路和方向，體育課教學堅持以培養終身體育鍛煉意識，養成終身體育鍛煉習慣，掌握終身體育鍛煉方法為指導，以終身體育為導向,以群眾體育為基礎,以課程教學為核心,以競技體育為形象,以科研創新為動力,以身心健康為目標,促進學生身心健康的全面發展。通過體育教育讓學生熱愛體育運動，養成良好的運動習慣，培養學生生理、心理和社會適應的健全人格。
體育部現有校級重點學科——“民族傳統體育學”，民族傳統體育學是一門與體育運動實踐密切相關的綜合性學科，該學科下設武術套路教學與訓練研究、瑜伽理論與實踐研究、民族傳統體育養生與保健文化研究三個學科方向。學科目前已擁有較強的師資力量，形成了精干的教學與科研隊伍。創編了《大學體育運動與健康》、《體育傳統運動養生學》等30余部相關著作，在國內外重要學術刊物發表文章共20余篇。
我校依托中醫藥學科優勢，重點發展傳統保健運動與武術項目，我校武術運動項目始于上世紀80年代，通過30余年的不斷發展和完善，現已組建成一支團結進取，運動水平較高、競技實力較強的武術校隊，并多次獲得全國中醫藥院校民族傳統保健運動會武術比賽及湖北省大學生武術比賽的冠軍。同時我校武術項目目前不僅已成為我校提高中醫人才培養質量、形成學校專業特色的重要內涵，同時在參與運動競賽和展示中醫藥文化、濃厚校園文化氛圍乃至開展國際文化交流中都取得了顯著成績，并成為我校的一大特色品牌。
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