蘭州大學藥學院創建于1959年，初建為藥學系，2002年正式成立為藥學院，自創立至今已有44年歷史。44年以來，藥學院經歷了時代的巨變和風雨的鍛煉，今天，藥學院已逐步形成辦學指導思想明確、辦學思路清晰、辦學定位準確、特色較為鮮明的，為甘肅省培養研究生、本科生、?？粕?、各類成人教育及繼續教育等多層次的藥學專業人才基地。
藥學院下設8個教研室，分別是：藥物化學教研室、藥理學教研室、生藥與藥用植物學教研室、藥物分析學教研室、藥劑學教研室、藥事管理學教研室、分析化學與物理化學教研室及天然藥物化學教研室；有1個藥學基礎實驗室，2個專業實驗室：中藥制劑實驗室、中藥生藥鑒定實驗室，另設有一個中草藥研究所。
藥學院與甘肅省較大規模的蘭州大學第一附屬醫院、蘭州大學第二附屬醫院、甘肅省人民醫院、三愛堂醫院、蘭州空軍總醫院、鐵路中心醫院、蘭州陸軍總院等機構建立了長期的教學協作關系，擁有相對穩定的藥學見習與實習基地。
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