蘭州大學基礎醫學院前身為1932年12月成立的甘肅學院醫學專修科的醫學基礎各教研室，現擁有甘肅省新藥臨床前研究重點實驗室、17個教學科研基層組織和3個科學研究中心。
學院現有教學科研人員131人，其中教授27人，副教授35人，“教育部長江學者特聘教授”1人，“教育部長江學者講席教授”1人，國家杰出青年科學基金獲得者1人，“萃英講席教授”7人，入選教育部“新世紀優秀人才支持計劃”2人，“跨世紀學科帶頭人”8人。
學院現有二級學科博士點3個：中西醫結合臨床、遺傳學、生物化學與分子生物學；省級重點一級學科2個：中西醫結合、基礎醫學；一級學科碩士點2個：中西醫結合、基礎醫學；二級學科碩士點10個：生理學、病理學與病理生理學、病原學、人體解剖學與組織胚胎學、生物化學與分子生物學、中西醫結合臨床、免疫學、中西醫結合基礎、遺傳學、藥理學；本科專業5個：臨床醫學、麻醉學、醫學影像學、醫學檢驗、護理學。教育部創新團隊一個：“多肽藥物”創新團隊；省級實驗室一個：甘肅省實驗動物質量檢測實驗室；省級實驗教學示范中心一個：基礎醫學實驗教學中心。
學院建有醫學實驗中心科學研究開放平臺，實驗室面積12000多m2，大型、精密科研實驗儀器200多臺（件）、設備總價值4000萬元，面向全校開放。
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