甘肅農業大學食品科學與工程學院是甘肅省成立最早、食品類學科專業最全的學院。1988年甘肅農業大學進行專業整合成立食品科學與工程系，1989年開始第一次招生，2004年院系合并后成立食品科學與工程學院。現有動物性食品營養與工程博士學位授權點，農產品加工與貯藏工程、營養與食品衛生學、食品科學、動物性食品營養與工程碩士學位授權點，食品加工與安全（農業推廣）專業碩士學位授權點，食品科學與工程、生物工程、食品質量與安全、葡萄與葡萄酒工程四個全日制本科專業，食品科學與工程自學考試本科專業。現有在校全日制本科生1187名、碩士生167名、博士生11名、農業推廣碩士研究生56人。學院已形成了具有博士、碩士、本科多層次的高等教育體系。
學院現有教職員工45人，其中教授8人、副教授10人、講師14人、助教2人、高級實驗師1人、實驗師1人、助理實驗師4人、專職管理人員5人。教師中博士學位獲得者15人，碩士學位獲得者23人，入選國家現代農業（肉牛牦牛）產業技術體系崗位專家1人，教育部高等學校高職高專食品類專業教學指導委員會副主任委員1人，甘肅省領軍人才第一層次人選1人，甘肅省“333”人才工程2人、“555”人才工程3人。教師來自于澳大利亞悉尼大學、江南大學、清華大學、浙江大學、四川大學、蘭州大學、山東大學、西北農林科技大學、西北大學、陜西師范大學等國內外著名院校。
學院食品科學與工程實驗教學中心成立于2004年，2007年被評為甘肅省實驗教學示范中心，現有食品品質分析、食品生化、生物分離工程、食品微生物及發酵、加工工藝、農畜產品貯藏保鮮六個功能實驗室。中心現有實驗室面積3800m2，現有儀器設備810臺（件套），設備總值1200萬元。下設甘肅省農畜產品加工貯藏重點實驗室、甘肅省果蔬加工示范實驗室、甘肅省畜產品工程技術研究中心、甘肅省葡萄酒產業技術研發中心、甘肅省干酪素工程技術研究中心、甘肅省干酪素工程技術研究中心、甘肅省變性淀粉工程技術研究中心、甘肅省乳品行業生產力促進中心、甘肅農業大學雪頓生物乳業技術研究中心、臨夏什錦集團清真食品研究所（掛靠）、甘肅隴萃堂玫瑰（百合）產品研發中心。
建院20多年來，辦學規模逐漸擴大，師資力量不斷增強，教學質量明顯提高，科學研究及服務社會的能力得到加強。近年來，與甘肅省進出口商品檢疫檢局中心實驗室、甘肅省疾病控制中心實驗室、甘肅省技術監督局食品質量檢測中心、甘肅省輕紡研究院、甘肅省綠色食品辦公室、莫高葡萄酒業有限公司、蘭州莊園乳品有限公司、甘肅長城果汁有限公司、圣大方洲變性淀粉有限公司、榮華生化集團等20多家企事業單位建立了密切的合作關系和校外教學科研基地，為本科生培養及科學研究提供了保障。學院與美國、加拿大、法國、澳大利亞、德國、意大利、荷蘭、日本、泰國、新西蘭等國十多所院校和科研機構建立了業務往來，與中國科學院及國內絕大多數省市的兄弟院校建立了科研和教學協作關系。
學院注重研究內容的傳承和特色的凝練，學科和科研工作成效顯著，近五年先后獲國家科技進步二等獎1項，省部級科技進步獎15項、廳局級科技進步獎10項，獲得發明專利16項。在國內外各類專業學術刊物上發表論文580篇，其中SCI收錄23篇，EI收錄12篇，ISTP收錄12篇。主編、參編教材19部，專著4部。
學院在牛羊肉系列產品的研制、新型乳制品的開發、肉類保鮮包裝技術的研究、小雜糧食品、甘肅特色果蔬開發、果蔬采后病害、西北特色食物的營養成分及其檢測技術形成自己的特色，學科已成為甘肅省最具發展潛力的新興學科。采后生物學、畜產品加工、農產與果蔬加工、營養與食品衛生等作為特色優勢專業方向，近年來開展了大量的科學研究工作。目前學院承擔了甘肅省80%的食品類研究項目。近五年來，學院承擔國家科技支撐計劃子課題4項，國家自然基金12項，國家農業產業技術體系項目1項，農業部項目1項，國家863計劃子課題1項，“十二五”國家科技支撐1項，國家星火項目4項，教育部項目3項，甘肅省發改委科研教學平臺建設項目2項，甘肅省重大專項4項，甘肅省科技攻關項目3項，其它項目21項，到位科研經費3160多萬元；另外，還主持與企業橫向合作項目25項目，經費150萬元。推廣科研成果50項，為企業新增產值1.8億元，產生了顯著的經濟效益和社會效益，為推動我省農產品加工業和食品科技的發展做出了重要的貢獻。
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