根據教高【2003】4號文件批準，北京交通大學軟件學院于2003年3月成立，是37所國家示范性軟件學院之一。2006年11月通過教育部示范性軟件學院評估驗收，經《教育部辦公廳關于公布示范性軟件學院驗收結果的通知》（教高廳【2006】7號）文件批準，首批通過教育部示范性軟件學院評估驗收。
學院堅持內涵發展，優化結構，強化特色，注重創新，已培養高素質國際化軟件人才為目標，學院面向產業需求、突出工程能力與職業素養、強調團隊合作、強化實踐環節，在國際化環境與工程實踐環境中培養具有創新意識的精英型軟件工程師。學院堅持改革創新，與國際著名高校積極開展交流項目，與國內外知名企業深入開展產學研合作，積極探索以人才培養為目標的產學合作教育管理體制和以人才培養質量為保障的運行機制，建構了重能力培養、促素質提高的課程體系，探索了有效提升工程實踐能力和英語實用能力的教學模式與培養途徑。
學院依托北京交通大學自身的優勢，師資力量雄厚，擁有一支專兼結合、內外結合的國際化多元化師資隊伍。聘請來自英國、美國、加拿大等國家的13名外籍教師和55名知名企業的有海外背景的優秀工程師為學院專職或兼職教師。2010年，學院軟件工程專業教學團隊獲評國家級、北京市級優秀教學團隊，并獲評國家級精品課2門、國家級雙語教學示范課1門。學院下設軟件工程系、軟件工程研究中心和軟件服務外包實驗教學中心，辦公面積達3000多平方米。
學院每年招收軟件工程專業本科生180人，雙證軟件工程碩士研究生120人，單證軟件工程碩士500人，留學生120人，在校生規模達2000余人。畢業生連續七年一次性就業率100%，進入國際知名企業、深造和出國率逐年增加，已達到85%以上。
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