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植保學院的前身是1960年設于原農學系的植物保護專業，1973年獨立建系。學院先后創設農業環境保護專業（環境工程專業）、應用微生物專業（生物技術專業）、環境科學專業、生態學專業、動植物檢疫專業。2004年經學校院系、學科調整后更名為植物保護學院。

學院現有植物病理學、農業昆蟲與害蟲防治、農藥學3個省級重點學科、安徽省農產品安全重點實驗室和安徽省植保技術培訓中心，擁有農業昆蟲與害蟲防治、作物安全博士學位授權點，植物病理學、農業昆蟲與害蟲防治學、農藥學3個二級學科碩士學位授權點，植物保護學一級學科碩士授權點、植物保護和動植物檢疫2個本科專業和應用微生物與昆蟲資源利用2個研究所，一個本科實驗教學中心，在讀研究生60余人、本科生700多人。獨立建系以來共為社會培養碩士研究生200余人、本專科生4000余人。學院現有教職工36人，其中教授7人，副教授及其它副高職稱16人，博士及博士在讀16人，博士生導師2人，省跨世紀學科帶頭人4人，省高校中青年學科帶頭人4人，省拔尖人才1人，教育部和省級骨干教師2人，省模范教師、省優秀教師、省師德先進個人3人。學院學術氣氛濃厚，近年來承擔國家和省級科研項目30余項，獲省部級獎勵5項，出版專著教材30余部，發表學術論文近300篇。本科教學具有優勢和特色，獲省級教學成果2項，主干課程均為省級精品課程。先后邀請國外專家18人次、國內著名專家、院士16人次來院開展學術交流活動，并先后派出教師10余人次出國訪問、進修、60余人次參加國內外學術會議。

學院黨建工作近年來取得優異成績，先后被省委、組織部、宣傳部、教育工委和校黨委授予先進基層黨組織榮譽稱號，多人榮獲優秀黨員、優秀黨務工作者稱號。學院學生工作成效明顯，豐富多彩的文體活動陶冶學生的情操，扎實濃郁的學術氛圍夯實學生的知識，連續三年榮獲省級大學生社會實踐先進集體，并多次獲省級、校級獎勵。學院注重學生綜合素質的提高，在高校就業競爭日益激烈的情況下，近年來植保專業畢業生的考研率均位居學校首位，2006年考研錄取率達50％，就業率一直位居學校前列。

學院堅持研究教學型的辦學定位，秉承嚴謹、求實的學風，團結、創新的作風，努力彰顯我校傳統學科的優勢與特色。

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