信息工程學院成立于2013年6月，學院下設3個正科級機構：學院辦公室、學生工作辦公室、教學科研辦公室；3個教研室：信息工程教研室、軟件工程教研室、計算機基礎教研室；1個研究所：中醫藥信息化研究所。
學院現有教職工23人，其中教師20人；副教授9人，高級工程師1人，講師11人；博士1人，碩士18人，碩士以上學歷教師達到90％。師資隊伍整體結構比較合理，有豐富的教學經驗。學院現設醫學信息工程專業1個，承擔醫學信息工程c語言、計算機導論、面向對象程序設計、計算機組成原理等專業課程和全校計算機應用公共課及醫學信息系統、VFP程序設計、flash制作、photoshop設計、多媒體課件設計等選修課程。
學院現有計算機教學機房5個，網絡實驗室1個，微機原理實驗室1個，醫學信息系統實驗室1個，醫學數據挖掘實驗室1個，接口技術與嵌入式系統1個，電子學習室1個。具備較強的學科支撐和實驗教學條件，實驗教學的軟硬件條件都能滿足本專業開設的需要。到2015年建成軟件開發與測試實訓室1個、嵌入式系統實驗室1個；到2016年建設虛擬社區醫院實驗室1個，網絡工程綜合實訓室1個。到2017年與各教學醫院實現網絡互連，建設遠程診療實訓室1個。學院以數字化校園為基礎，積極建設數字化附屬醫院，加快中醫藥信息化的建設進程，努力建成中醫藥信息化教學、科研、醫療的公共平臺。
學院堅持科研工作同教學相結合的方針，近五年來承擔省級科研項目20余項，教改課題8項，出版學術專著、合著近30部，發表學術論文80余篇，獲得甘肅省教學成果一等獎1項，二等獎1項，廳級獎1項。
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