對阿米巴病的診斷，除根據患者的主訴、病史和臨床表現作為診斷依據外，重要的是病原學診斷，糞便中檢查到阿米巴病原體為唯一可靠的診斷依據。通常以查到大滋養體者作業現癥患者，而查到小滋養體或包囊者只作為感染者。
在作診斷時，或腸阿米巴病不應忽視，因阿米巴病缺乏特殊的臨床表現。該病起病較慢，中毒癥狀較輕，容易反復發作，腸道癥狀或痢疾樣腹瀉輕重不等，故對腸道紊亂或痢疾樣腹瀉而病因尚未明確，或經磺胺藥、抗生素治療無效應疑為本病。
（一）臨床表現：
阿米巴腸病潛伏期長短不一，自1～2周至數月以上不等，雖然患者早已受到溶組織內阿米巴包囊感染，僅以共棲生存，當宿主抵抗力減弱以及腸道內感染等，臨床上始出現癥狀。根據臨床表現不同，分為以下類型：
1、無癥狀的帶蟲者：患者雖然受到溶組織內阿米巴的感染，而阿米巴原蟲僅作共棲存在，約有90%以上的人不產生癥狀而成為包囊攜帶者。在適當條件下即可侵襲組織，引起病變，出現癥狀。因此，從控制傳染源及防止引起致病的觀點出發，以于包囊攜帶者應引起足夠的重視，必須給予治療。
2、急性非典型阿米巴腸病：發病較緩慢，無明顯全身癥狀，可有腹部不知，僅有稀便，有時腹瀉，每日數次，但缺乏典型的痢疾樣糞便，而與一般腸炎相似，大便檢查可發現滋養體。
3、急性典型阿米巴腸病：起病往往緩慢，以腹痛腹瀉開始，大便次數逐漸增加，每日可達10～15次之多，便時有不同程度的腹痛與里急后重，后者表示病變已波及直腸。大便帶血和粘液，多呈暗紅色或紫紅色，糊狀，具有腥臭味，病情較者可為血便，或白色粘液上覆蓋有少許鮮紅色血液。患者全身癥狀一般較輕，在早期體溫和白細胞計數可有升高，糞便中可查到滋養體。
4、急性暴發型阿米巴腸病：起病急劇，全身營養狀況差，重病容，中毒癥狀顯著，高熱，寒戰、譫妄、腹痛、里急后重明顯，大便為膿血便，有惡臭，亦可呈水樣或轎水樣便，每日可達20次以上，伴嘔吐、虛脫，有不同程度的脫水與電解質紊亂。血液檢查中性粒細胞增多。易并發腸出血或甩穿孔，如不及時處理可于1～2周內因毒血癥而死亡。
5、慢性遷延型阿米巴腸病：通常為急性感染的延續，腹瀉與便秘交替出現，病程持續數月甚至數年不愈，在間歇期間，可以健康如常。復發常以飲食不當、暴飲暴食、飲酒、受寒、疲勞等為誘因，每日腹瀉3～5次，大便呈黃糊狀，可查到滋養體或包囊。患者常伴有臍擊或下腹部鈍痛，有不同程度的貧血、消瘦、營養不良等。
（二）病原學檢查：
1、糞便檢查：
（1）活滋養體檢查法：常用生理鹽水直接涂片法檢查活動的滋養體。急性痢疾患者的膿血便或阿米巴炎病人的稀便，要求容器干凈，糞樣新鮮、送檢越快、越好，寒冷季節還要注意運送和檢查時的保溫。檢查時取一潔凈的載玻片，滴加生理鹽水1滴，再以竹簽沾取少量糞親，涂在生理鹽水中，加蓋玻片，然后置于顯微鏡下檢查。典型的阿米巴痢疾糞便為醬紅色粘液樣，有特殊的腥臭味。鏡檢可見粘液中含較多粘集成團的紅細胞和較少的白細胞，有時可見夏科一雷登氏結晶（Charcot-Leydencrystals）和活動的滋養體。這些特點可與細菌性痢疾的糞便相區別。
（2）包囊檢查法：臨床上常用碘液涂片法，該法簡便易行。取一潔凈的載玻片，滴加碘液1滴，再以竹簽沾取少量糞樣，在碘液中涂成薄片加蓋玻片，然后置于顯微鏡下檢查，鑒別細胞核的特征和數目。
2、阿米巴培養：已有多種改良的人工培養基，常用的如洛克氏液、雞蛋、血清培養基，營養瓊脂血清鹽水培養基，瓊脂蛋白胨雙相培養基等。但技術操作復雜，需一定設備，且阿米巴人工培養在多數亞急性或慢性病例陽性率不高，似不宜作阿米巴診斷的常規檢查。
3、組織檢查：通過乙狀結腸鏡或纖維結腸鏡直接觀察粘膜潰瘍，并作組織活檢或刮拭物涂片，檢出率最高。據報道乙狀結腸、直腸有病變的病例約占有癥狀患者的2/3，因此，凡情況允許的可疑患者都應爭取作結腸鏡檢，刮拭物涂片或取活組織檢查。滋養體的取材必須在潰瘍的邊緣，鉗取后以局部稍見出血為宜。膿腔穿刺液檢查除注意性特征外，應取材于膿腔壁部，較易發策滋養體。
（三）免疫診斷：
近年來國內外陸續報告了多種血清學診斷方法，其中以間接血凝（IHA）、間接熒光抗體（IFAT）和酶聯免疫吸附試驗（ELISA）研究較多，但敏感性對各型病例不同。IHA的敏感較高，對腸阿米巴病的陽性率達98%，腸外阿米巴病的陽性率達95%，而無癥狀的帶蟲者僅10%～40%，IFA敏感度稍遜于IHA.EALSA敏感性強，特異性高，有發展前途。補體結合試驗對診斷外阿米巴亦有圈套意義，其陽性率可達80%以上。其他如明膠彌散沉淀素試驗、皮內試驗等均有輔助診斷的價值。近年來，已有報道應用敏感的免疫學技術在糞便及膿液中檢測阿米巴特異性抗原獲得成功。特別是抗阿米巴雜音瘤單克隆抗體的應用為免疫學技術探測宿主排泄物中病原物質了可靠、靈敏和抗干擾的示蹤式具。
（四）診斷性治療：
如臨床上高度懷疑而經上述檢查仍不能確診時，可給予足量吐根堿注射或口服安痢平、滅滴靈等治療，如效果明顯，亦可初步作出診斷。
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