藥學院位于廣東醫學院東莞校區， 2004年起招收首屆藥學專業本科生，現設有化學、藥理學、生藥學、藥物化學、藥物分析、藥劑學、中藥學與醫藥貿易學等七個教研室和一個化學與藥學實驗教學中心（省級教學示范中心）。現有教職工84人，專業教師60人，其中省級教學名師1名，校級教學名師2名，教授12人、副教授19人，副高以上職稱教師占教師總人數52%。具有博士學位的教師28人，占教師47%。擁有藥理學碩士學位授予點，現有博士生導師1人，碩士生導師46人，是一個集教學、科研與開發、社會服務為一體的教育機構。
藥學院擁有紅外光譜儀、高效液相色譜儀、氣相色譜儀、micro-CT等先進科學儀器設備，依托廣東天然藥物研究與開發重點實驗室，廣東醫學院中藥與新藥研究所等科研平臺，近3年來教師共承擔國家、省部、廳級課題60余項，獲經費資助1700余萬元；獲得省級科技進步獎1項，是廣東省高等學校教學質量工程專業綜合改革試點單位。主編、參編學術專著10余部，在國內外專業期刊發表科研論文300余篇，其中SCI收錄89篇。申報國家發明專利60多項，獲授權19項，轉讓專利成果1項。在骨質疏松基礎研究及新藥研究，藥物透皮吸收及皮膚外用藥，抗腫瘤，防治支氣管哮喘，糖尿病，肝硬化等藥物研究方面形成了穩定的研究方向，正在開發系列的具有獨立知識產權的新藥。
藥學院目前在校本科學生2308人，有藥學、中藥學兩個專業和藥物分析、臨床藥學、醫藥貿易三個專業方向。先后與康美藥業、麗珠藥業、東莞藥檢所等近80余家單位建立了良好實習就業合作關系。重點向醫院，藥品生產、檢驗、流通等領域培養創新型人才及實用型人才，畢業生主要從事藥物分析與檢驗、醫院藥房管理，藥品流通及藥品監督等方面工作。近幾年來畢業生就業率均超過92%，其中2012屆達到了99.39%。
藥學院在本科教育中重視創新性教學，鼓勵學生參加科研活動。近四年我院學生省級課題立項23項，獲資助金額46萬元，校級課題46項，獲資助金額近14萬元，已發表論文21篇。
藥 學
四年制 招收理科
授予本科畢業證書、理學學士學位
培養目標：培養德、智、體全面發展的掌握藥學基本技能，具有較強的藥學工作能力的高素質藥學專門人才。本專業要求學生掌握藥學專業的基本理論、基礎知識和基本技能；掌握藥品的制備、質量控制和檢驗、藥物與生物體相互作用、藥效學和藥物安全性評估等基本方法和技能；具有藥物制劑的初步設計能力、選擇藥物分析方法的能力、指導臨床合理用藥的能力；熟悉藥事管理的政策、法規和藥品營銷的基本知識；了解現代藥學的科學技術新進展；掌握文獻檢索、資料查詢的基本方法，具有科學研究的創新能力和實際工作的應用能力。
主要專業課程：以化學、藥學和醫學為主干學科，主要課程有無機化學、有機化學、分析化學、儀器分析、生物化學、人體解剖學、生理學、病理學、藥理學、藥物化學、藥物分析、臨床藥理學、藥劑學、藥事管理學、藥用植物學與生藥學、天然藥物化學等。
就業方向：畢業后在醫療衛生部門、藥品監督與管理部門、醫藥院校、醫藥科研機構和醫藥企業等單位，從事藥物分析、藥物設計、藥物制劑制備、臨床合理用藥、醫院藥房管理、藥品監督和醫藥教育等工作。
中藥學
四年制 招收理科
授予本科畢業證書、理學學士學位
培養目標：培養德、智、體全面發展的具備中藥學基礎理論、基本知識、基本技能并了解中醫學與現代藥學的高級科學技術人才。本專業重點培養學生掌握中藥鑒定、中藥炮制、中藥制備、中藥質量控制評價及研究的基本能力，了解中醫學和現代藥學的基本理論和知識；掌握中醫基礎理論、中藥化學、中藥制劑分析、中藥藥理學、中藥學、方劑學、中藥藥劑學、藥用植物學、中藥鑒定學、中藥炮制學等學科知識；熟練結合運用傳統中藥學和現代藥學的知識與理論，掌握中藥現代化研究的實驗技能；掌握運用中藥制藥技術、中藥新藥開發技術及中藥經營管理知識；熟悉藥事管理法規、政策與藥品監督的基本知識。了解現代藥學的科學技術新進展。
主要專業課程：以化學、藥學、中藥學為主干學科，主要課程有無機化學、分析化學、有機化學、中醫學基礎理論、中藥學、方劑學、藥用植物學、中藥藥理學、中藥化學、中藥鑒定學、方劑學、中藥藥劑學、中藥炮制學、中藥制劑分析等。
就業方向：畢業后在醫療衛生部門、藥品監督與管理部門、醫藥院校、醫藥科研機構和醫藥企業等單位；在中藥生產、檢驗、流通、使用和研究與開發領域從事中藥分析、鑒定、設計、制劑、臨床合理用藥、醫院藥房管理、藥品監督和中醫藥教育等工作。
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