食品工程系是學校發展較早的系部之一，現開設有食品科學與工程、食品質量安全兩個本科專業和食品營養與檢測?？茖I，形成以食品加工、食品工程設計、食品營養與保健為重點的辦學特色。
食品工程系由加拿大籍楚天學者李毅教授擔任教學牽頭人，以江南大學、華中農業大學、華南農業大學等院校畢業的博士組成青年教師團隊，教師中具有碩士、博士學位的超過96%，食品工程系擁有優越的科研基地和先進的技術平臺，與武漢多所院校和科研機構建立了密切聯系。近幾年，教師承擔了省、市級及校級的10項科研課題和8項教研課題，在國內外核心期刊發表學術論文五十多篇，出版教材十余部。
食品工程系本著“理論與技術并行，知識服務產業”的核心理念，著力于應用型、創新型人才的培養，重視實踐教學，擁有伊利、蒙牛、仟吉等50余個穩定的畢業生實習實訓和就業基地，先后與湖北省人力資源和社會保障廳、武漢市人力資源和社會保障局、中國檢驗認證集團、中國質量認證中心等政府機構和部門組織建立了密切的合作關系，讓學生在畢業前獲得食品安全師、食品營養師等職業證書。
畢業生就業率一直保持在98%以上，85%以上的畢業生在省內外衛生、檢疫檢驗、農業、生物能源、環境與資源以及食品加工等行業從事與專業相關的生產、設計、管理、研發、營銷、檢驗等工作。一大批優秀畢業生考取國家重點大學碩士研究生，普通本科生考研率一直保持在學校院系前列，涌現出了一大批自辦公司、成功創業的優秀校友典型。
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