1.日光與紫與外
日光是有效的天然殺菌法，對大多數微生物均有損害作用，直射殺菌效果尤佳，其主要的作用因素為紫外線，此外，熱與氧氣起輔助作用。但光線效應受很多因素的影響，如煙塵籠罩的空氣、玻璃及有機物等都能減弱日光的殺菌力。
紫外線是一種低能量的電磁輻射，波長范圍為240～280nm，最適的波長為260nm，這與DNA吸收光譜范圍相一致。其殺菌原理是紫外線易被核蛋白吸收，使DNA的同一條螺旋體上相鄰的堿基形成胸腺嘧啶二聚體，從而干攏DNA的復制，導致細菌死亡或變異。紫外線的穿透能力弱，不能通過普通玻璃、塵埃，只能用于消毒物體表面及空氣、手術室、無菌操作實驗室及燒傷病房，亦可用于不耐熱物品表面消毒。殺菌波長的紫外線對人體皮膚、眼睛均有損傷作用，使用時應注意防護。
2.電離輻射
包括高速電子、X線和r線等。具有較高的能量與穿透力，可在常溫下對不耐熱的物品滅菌，故又稱“冷滅菌”。其機理在于產生游離基，破壞DNA.可用于消毒不耐熱的塑料注射器和導管等；亦能用于食品消毒而不破壞其營養成份。
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