顯微鑒定(microscopical identification)法是利用顯微技術對中藥進行顯微分析，以確定其品種和質量的一種鑒定方法。適用于性狀鑒定不易識別的藥材、完整的、破碎的或粉末狀藥材以及含飲片粉末的各種中成藥制劑的鑒定。顯微鑒定主要包括組織鑒定和粉末鑒定，通過顯微鏡觀察藥材的組織構造、細胞形狀及內含物的特征、礦物的光學特性和用顯微化學方法確定細胞壁及細胞內含物的性質或某些品種有效成分在組織中的分布等，用以鑒別藥材的真偽與純度甚至品質，以及對中成藥是否按處方規定投料進行鑒定。
顯微鑒定時可根據檢品的不同情況(完整藥材、破碎藥材、粉末或中成藥等)選擇具有代表性的供試品，根據各品種的顯微鑒別項制作相應的制片，進行顯微觀察和鑒別。
(一)顯微制片方法
1．橫切面或縱切面制片 2．表面制片3．粉末制片4．解離組織片5．花粉粒與孢子制片6．磨片制片 7．含飲片
(二)植物細胞壁和細胞后含物性質的鑒別
1．細胞壁性質的鑒別
2．細胞后含物性質的鑒別
(三)顯微測量
(四)顯微臨時制片常用封藏試液
(五)掃描電子顯微鏡和偏光顯微鏡的應用
1．電子顯微鏡(簡稱電鏡)
2．偏光顯微鏡
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