一、藥物及化學物質
這種物質根據其作用可分成兩大類：一類與毒物的劑量有關，只要所接觸的劑量較大，任何人均能發生骨髓再生障礙，如氮芥、環磷酰胺、6-巰嘌呤、馬利蘭等抗腫瘤藥物;另一類是在接觸到治療劑量(藥物)或一般劑量時偶爾可在某些人中引起再障，如氯(合)霉素、保泰樺、磺胺類等藥物。其中特別值得提出氯(合)霉素是藥物引起再障中最多見的病因，這與這種藥物的濫用有關。這種藥物是一種氮苯衍生物，在多數情況下，骨髓抑制的程度與藥物劑量有關，能引起短期可逆性的骨髓抑制。其作用是因骨髓細胞內線粒體的蛋白合成受到了抑制，停用藥物后，骨髓抑制常可恢復，在很少數情況下(發生率約為1/2～4萬→1/20 萬)，骨髓抑制與藥物劑量無關，似乎是一種對藥物的特異性反應(可能有一種先天酶的缺陷導致核酸合成上缺陷，也可能是一種過敏反應)，即使與藥物已停止接觸，嚴重的骨髓抑制仍長期持續存在，保泰松也能引起再障，與藥物劑量亦無關，其發生機會僅次于氯霉素。
苯是工業用化學物品中用途最廣，也是最重要的骨髓抑制毒物。它引起再障似與劑量無關，可能是一種特異性反應，不過長期與苯每天接觸比一次大劑量接觸的危險性更大。偶爾可以與苯已停止接觸后數月甚至數年才出現骨髓抑制現象。
二、電離輻射
各種電離輻射如X線、放射性同位素等除了損傷造血干細胞還可損傷造血微環境，影響干細胞的增殖和分化。損傷程度與接觸核輻射劑量有關。
三、感染
再障可以發生于病毒性肝炎之后，甲、乙二型肝炎均可致病。約10-20%年輕患者在全血細胞減少6周以前有肝炎史。這種病例往往比較嚴重。通常認為有關的病毒既能影響肝臟，又能影響骨髓，所謂原發性再障病例中不少在起病前曾有病毒性呼吸道感染。
四、其它
再障可發生于妊娠時，分娩后貧血減輕或緩解。近年發現有少數再障病人的紅細胞對補體敏感，也有少數陣發睡眠性血紅蛋白尿病例最后逐漸演變成典型的再障。
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