一般腸套疊是順行的，近端腸管套進遠端腸管內，有極少數病例，腸套疊可以是逆行的。腸套疊的外管部分稱腸套疊鞘部;腸的近端套入其中。進到里面的部分稱套入部;腸管從外面卷入處，名為套疊頸部，而腸套疊的進入部最遠點稱為腸套疊頭部。
腸套疊由于套入部位不同而可分成下列幾種類型：
一、回盲型：約占總數的50%～60%;
二、回結型：約占30%;
三、回回結型：占10%左右;
四、小腸型：即小腸套入小腸，比較少見;
五、結腸型：結腸套入結腸，也很少見;
六、多發型腸套疊，罕見。
腸套疊一旦形成很少有自動復位者，嚴重的晚期病例甚至可以自肛門脫出。腸套疊的腸梗阻，主要是由于鞘部的收縮，尤其是頸部壓迫套入部而堵塞腸腔，使血液循環受到障礙。
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