細胞的內膜蛋白，外膜蛋白和周質蛋白是怎樣越過內膜而到其目的地的呢?絕大多數越膜蛋白的N端都具有大約15-30個以疏水氨基酸為主的N端信號序列或稱信號肽。信號肽的疏水段能形成一段α螺旋結構。在信號序列之后的一段氨基酸殘基也能形成一段α螺旋，兩段α螺旋以反平行方式組成一個發夾結構，很容易進入內膜的脂雙層結構，一旦分泌蛋白質的N端錨在膜內，后續合成的其它肽段部分將順利通過膜。疏水性信號肽對于新生肽鏈跨膜及把它固定的膜上起一個拐掍作用。之后位于內膜外表面的信號肽酶將信號肽序列切除。當蛋白質全部翻譯出來后，羧端穿過內膜，在周質中折疊成蛋白質的最終構象。
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