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近年來，在各項政策措施的正確引領下，我國對科技的投入持續增長，科技體制改革也在不斷進行創新。與此同時，科研環境也不斷發生變化并得到改善，但目前依然存在著較多問題，其中的四個方面已經制約著我國科技發展：

一、項目申請難嚴重影響我國科研工作的正常開展。在科研立項上開展競爭，讓有能力的科研人員獲得更多的資源和機會，這是科研體制改革的初衷。可是，過度競爭和競爭機制的不規范，使許多科研人員將時間、精力投入到申請環節，必然影響科研工作的正常開展。不少課題組的負責人表示，為了生存，必須耗費很大精力去爭取項目，沒有更多的時間去做實驗、做研究等。調查數據顯示，我國科技工作者每年用于科研的時間，平均低于4個月。而財政支持項目的申請周期相對較長，在3個月以下能夠申請成功的較為罕見，一年內可以解決的也只占60％左右。

二、單一的投資渠道大大制約了科研領域的創新。與發達國家相比，目前我國科研經費總量不大，而且渠道單一。在基礎研究領域，除了政府的科研計劃項目外，只有國家自然科學基金委員會項目。為了使科學研究得到全社會的支持，就要進行科研投入體制的創新。從發達國家的經驗來看，大力發展各類民間科研基金會是其中一個重要的渠道。從具體形式來看，在科學基金會的建設方面可以有多重模式：支持基礎研究的基金會，資金來源可以立足于社會知名人士、科學家、企業家和慈善人士的捐助等，運行的方式主要是通過基金的利息和紅利來進行投入；支持應用性研究和技術開發類研究的基金會，其資金來源除了個人外，還可以吸引企業來捐助，一個企業家完全可以對一項攻克癌癥的研究給予支持。    

三、狹礙的“小圈子”現象降低了科研的效率。目前國家級的科研項目管理中也存在不少間題，立項和申請往往被部分學術權威或是所謂的“圈內”人把持，“圈外”其他科技工作者很難申請到資金支持力度較大的項目。形成的客觀情況就是少數人有較多的科研經費，而大多數人的經費很少。這樣的“小圈子”造成了一些長期申請不到課題的研究小組，最終只能放棄或者解散；同時，通過“小圈子”經常能夠申請到課題的小組，因為課題申請比較容易，也不會好好珍惜，不好好做課題。長此以往，我國的科研效率必將越來越低。同時，在科研項目申請中，決策的透明、公平和民主化被掩蓋，為增加了權錢交易等丑惡現象滋生的可能性。    

四、科研力量的分散制約了科技實力的發展。科研環境中的另一個問題是，我們的科研人員不能形成合力。國外很多優秀成果都是很多人形成團隊的成果，幾十個著名的研究員共同完成。而我們現在三五個研究人員在一起工作就已經很不錯了。不同的機構沒的課題組難以去聯合申請一個課題，而不管這個課題是否需要更多的力量來整合。課題組越來越小，力量越來越分散，影響了一些綜合性大課題，不易完成的“硬骨頭”項目，長期性項目的完成；具有國際競爭力的研究課題組不多，科研隊伍建設亟待加強，直接影響到我國科技的發展。   

因此，我們應加快建立與社會主義市場經濟體制相適應、符合科技發展規律的科技體制，更大程度地發揮市場配置科技資源的基礎性作用，大力發展各類民間科研基金會，建立科學盼評審機制，最大限度地激發廣大科技工作者和全社會的創新活力，不斷的解放和發展科學技術生產力。